9号染色体上与华东地区汉族人2型糖尿病相关候选基因的初步筛查

作者:骆天红 出处:上海第二医科大学附属瑞金医院

  目的：本课题组对华东地区102个2型糖尿病家系采用微卫星标记进行了全基因组扫描，发现9号染色体上D9S175位点和D9S171位点与华东地区汉族人2型糖尿病呈强烈连锁。本研究在此工作基础上，对D9S171和D9S175位点附近区域的候选基因进行突变及SNPs筛查，并应用SNP分型和病例－对照研究对这两个区域内可能与2型糖尿病相关的基因进行筛查。  方法：分别从与D9S171和D9S175位点相连锁的LOD值较高的24个家系中各取1个糖尿病患者样本作为突变及SNP筛查样品，在D9S171位点附近选择了11个基因，D9S175附近选择22个基因，对这些基因的启动子区、外显子区及其临近的内含子区进行直接测序检测突变及SNP。同时采用限制性酶切法、Snap-shot法和直接测序法对启动子区、外显子区和部分内含子区的SNP分别在2型糖尿病组和正常对照组人群中（195例 vs 189例）进行基因分型，通过关联分析检验这些SNP与2型糖尿病的相关性。  结果：在D9S171位点附近的11个候选基因中共筛查片段总长度约为58kb，其中启动子区约14kb, 外显子区约16kb，共发现87个SNP，其中高频SNP（等位基因频率>15%）54个，低频SNP33个。在ADFP基因外显子中有两个错义突变Ser252>Pro和Thr397>Ala分别在两个家系中与2型糖尿病共传递。TEK基因的一个SNP  TEKE14/105A>G在华东地区汉族2型糖尿病人群与正常人群分别为22%和11%，有显著差异（P＝0.0001）。在D9S175位点附近共筛查22个候选基因，总测序长度约114kb，共发现164个SNP，其中启动子区有60个，编码

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